Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS6KB1P23443 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms