Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCP2P22307 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCP2P22307 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2P22307 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2P22307 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2P22307 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCP2P22307 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms