Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT1P21579 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT1P21579 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT1P21579 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT1P21579 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYT1P21579 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT1P21579 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms