Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMNB1P20700 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMNB1P20700 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms