Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCNA2P20248 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCNA2P20248 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms