Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL2P19875 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL2P19875 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL2P19875 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL2P19875 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL2P19875 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CXCL2P19875 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CXCL2P19875 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms