Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF7P17544 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms