Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZSCAN20P17040 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZSCAN20P17040 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms