Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms