Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPCAMP16422 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms