Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAV1P15498 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAV1P15498 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAV1P15498 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAV1P15498 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAV1P15498 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAV1P15498 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAV1P15498 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAV1P15498 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAV1P15498 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAV1P15498 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAV1P15498 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms