Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRF1P14222 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRF1P14222 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRF1P14222 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRF1P14222 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRF1P14222 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRF1P14222 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms