Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RLBP1P12271 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms