Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD28P10747 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD28P10747 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD28P10747 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD28P10747 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms