Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HKR1P10072 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HKR1P10072 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HKR1P10072 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms