Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms