Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLA1P09884 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
POLA1P09884 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.78■■■■□ 3
POLA1P09884 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
POLA1P09884 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
POLA1P09884 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
POLA1P09884 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
POLA1P09884 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
POLA1P09884 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
POLA1P09884 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms