Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRPRAP08240 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms