Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB1P08034 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB1P08034 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB1P08034 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB1P08034 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB1P08034 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB1P08034 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB1P08034 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB1P08034 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms