Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEFMP07197 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEFMP07197 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEFMP07197 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEFMP07197 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NEFMP07197 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEFMP07197 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms