Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3DP05423 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3DP05423 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms