Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCAP05165 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCCAP05165 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCCAP05165 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCCAP05165 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCCAP05165 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCCAP05165 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCCAP05165 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCCAP05165 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCCAP05165 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCCAP05165 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms