Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms