Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APODP05090 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APODP05090 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APODP05090 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APODP05090 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APODP05090 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APODP05090 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APODP05090 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APODP05090 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APODP05090 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APODP05090 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APODP05090 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APODP05090 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APODP05090 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms