Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTNP04004 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTNP04004 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTNP04004 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTNP04004 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTNP04004 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms