Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
POLR1AO95602 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms