Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB11O95342 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCB11O95342 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms