Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GABARAPO95166 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABARAPO95166 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms