Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPFIA3O75145 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIA3O75145 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms