Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
ABCC9O60706 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
ABCC9O60706 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms