Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIN3BO60391 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN3BO60391 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms