Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK2O60296 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK2O60296 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms