Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNIP3LO60238 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNIP3LO60238 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms