Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN4O43707 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN4O43707 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms