Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRC1O43663 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRC1O43663 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRC1O43663 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRC1O43663 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms