Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNQ2O43526 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNQ2O43526 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms