Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATMINO43313 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATMINO43313 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATMINO43313 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATMINO43313 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATMINO43313 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMINO43313 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATMINO43313 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMINO43313 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATMINO43313 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms