Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CRXO43186 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CRXO43186 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CRXO43186 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CRXO43186 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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