Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNMO15061 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNMO15061 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNMO15061 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNMO15061 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNMO15061 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNMO15061 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNMO15061 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNMO15061 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNMO15061 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNMO15061 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNMO15061 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNMO15061 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNMO15061 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms