Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLGNO14967 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLGNO14967 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLGNO14967 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLGNO14967 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms