Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IKBKBO14920 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IKBKBO14920 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms