Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms