Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVV-2B6SEH9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVV-2B6SEH9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms