Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms