Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms