Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms