Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms