Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC5G-204ENST00000406962 1562 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB4-203ENST00000485064 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAIC-201ENST00000498938 1345 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7G3-201ENST00000305444 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRH2-202ENST00000396400 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG11B-205ENST00000398462 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED18-202ENST00000398997 1106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFY-AS1-201ENST00000417305 500 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU6F2-AS2-201ENST00000420243 514 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117378.1-202ENST00000421310 601 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P10-201ENST00000447708 612 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354707.1-204ENST00000451142 846 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL400P-201ENST00000473634 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL584P-201ENST00000492309 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001636.1-201ENST00000531997 1122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX7P-202ENST00000602449 655 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCG18-247ENST00000602698 573 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090950.1-201ENST00000604625 830 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF219-AS1-213ENST00000607860 577 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093726.2-201ENST00000609134 679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244472.3-201ENST00000611520 428 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL650P-201ENST00000619902 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109920.1-201ENST00000632749 415 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137798.3-201ENST00000639399 166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM20P3-201ENST00000508710 2106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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