Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL133406.1-201ENST00000404904 747 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TMEM211-202ENST00000423535 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC116050.1-206ENST00000423774 213 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IFNWP5-201ENST00000445100 588 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 BUB3P1-201ENST00000458451 999 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL3P10-201ENST00000476002 1164 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ERLIN2-210ENST00000523107 771 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 AC140658.1-201ENST00000563019 346 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL10P15-201ENST00000585756 315 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL7L1P5-201ENST00000590816 738 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF880-206ENST00000600321 953 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL158175.1-203ENST00000635654 1281 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 OLMALINC-206ENST00000641799 1195 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PDCD1Q15116 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 DYDC2-207ENST00000616870 1723 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 IL37-203ENST00000349806 589 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 HMGB1P39-201ENST00000366304 880 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LRRC72-202ENST00000401542 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ANXA2P3-201ENST00000404883 1008 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 BMP2KL-201ENST00000414251 1225 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC116609.1-201ENST00000425850 535 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC073342.1-201ENST00000427392 592 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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