Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms